Микробиота перекрёстнопарная в ландшафтном дизайне, фото и описание растения, сорта Якобсен, Карнавал и Голдспот
НазадСорта микробиоты перекрёстнопарной, их описание и применение
- Род микробиота и история открытия
- Видео: История открытия и описание микробиоты перекрёстнопарной
- Ботаническое описание микробиоты перекрёстнопарной
- Применение в ландшафтном дизайне
- Сорта микробиоты
- Карнавал
- Голдспот
- Лукас
- Болезни и вредители
- Хвойные деревья
- Микробиота
- Сорта микробиоты перекрёстнопарной, их описание и применение
14 лайков
Микробиота считается одним из наиболее экзотических видов хвойных растений, применяемых в современном ландшафтном дизайне.
Этот вид отлично вписывается в любую композицию на участке, при этом может стать и центром всей клумбы. В статье подробно рассмотрены главные характеристики этого декоративного кустарника, а также приведено описание наиболее популярных сортов растения.
- Видео: История открытия и описание микробиоты перекрёстнопарной
- Ботаническое описание микробиоты перекрёстнопарной
- Применение в ландшафтном дизайне
- Сорта микробиоты
- Якобсен
- Карнавал
- Голдспот
- Лукас
- Болезни и вредители
Род микробиота и история открытия
Под термином «микробиота» подразумевается специфический род вечнозелёных хвойных кустарников, входящих в семейство Кипарисовые. Состоит род всего из одного вида, так называемой микробиоты перекрёстнопарной (microbiota decussata).
В естественной среде это растение является типичным представителем флоры Дальнего Востока России.
Здесь растение массово встречается на довольно ограниченной территории, занимающей южные и западные склоны Сихотэ-Алиня. Именно поэтому данный вид занесён в Красную Книгу и считается редкой флорой, постепенно ограничивающей свою численность.
Для официальной науки это растение было открыто сравнительно недавно. Впервые его описал известнейший российский ботаник Иван Шишкин в 1921 году в одной из экспедиций по Ливадийскому горному хребту. Микробиота была обнаружена на вершине горы Хуалаза, которая сегодня носит название Криничная. Однако изначально учёный принял это растение за одну из разновидностей можжевельника.
В 1923 году благодаря академику Владимиру Комарову кустарник был выделен в отдельную группу. Изучая гербарные образцы, Комаров заключил, что перед ним ранее неизученное растение, которое очень похоже на плосковеточник восточный, широко встречающийся на юге Китая. Нередко его именуют как «биота», поэтому новый кустарник, как некая миниатюрная копия плосковеточника, был назван учёным «микробиотой».
На протяжении многих десятилетий микробиота была неизвестна в научном мире, изолированность СССР от прочих стран не позволили учёным представить свою находку за рубежом. Первые иностранные статьи о данном виде появились только в 90-х годах XX ст., что и считается началом культивирования этого вида в зоне искусственного ландшафта.
Видео: История открытия и описание микробиоты перекрёстнопарной
Ботаническое описание микробиоты перекрёстнопарной
Микробиота — это небольшой ветвистый кустарник хвойного типа. Его основную надземную массу представляют крупные и стелющиеся побеги, развивающиеся из прикорневой розетки. Максимальная высота кустарника не превышает 1 метра, при этом в среднем ему удаётся достигать длины до 50–80 см. В благоприятных условиях куст полностью покрывает территорию роста, создавая изящные вечнозелёные заросли диаметром в 2–5 м.
Ветви у микробиоты слегка уплощённые, с тонкой корой коричневого цвета. Они обильно покрыты небольшими мягкими и упругими хвоинками длиной до 2 см. Хвоя у кустарника овальная, чешуевидного типа, но на внутренней части ветвей при постоянной затенённости может приобретать игловидную форму.
Цвет хвои довольно насыщенный, всевозможных ярко-зелёных тонов. На протяжении осени и зимы оттенок меняется на бурый, после чего по мере оттепели восстанавливается до зелёного.
Кустарник относится к однодомным представителям флоры, поэтому размножается в естественной среде благодаря перекрёстному опылению. Проходит этот процесс на протяжении весны, что к началу осени позволяет сформировать мелкие овальные бескрылые коричневые семена. Мегастробилы у микробиоты чешуйчатые, сухие и вытянутые, шириной около 3 мм и длиной до 6 мм.
Каждая мегастробила формирует не более одной семечки. Корневая система у кустарника сильно разветвлённая, она имеет несколько главных корней, от которых отходят десятки более мелких дополнительных.
Растёт микробиота довольно медленно. Средний прирост растения составляет не более 7 см в год. При этом вид считается долгожителем, сегодня известно множество экземпляров, возраст которых насчитывает около 100 лет.
Важно! Микробиота не терпит пересадки, процедура крайне негативно воздействует на корневую систему и приводит к гибели кустарника. Вот почему перед посадкой растения обязательно нужно чётко спланировать все элементы ландшафта.
Применение в ландшафтном дизайне
Традиционно в ландшафтном дизайне растение используется как почвокровный вид. Всего несколько кустов способны создать густой ковёр, который может удачно дополнить любой приусадебный участок. При этом наиболее гармонично микробиота сочетается с любым другим хвойным деревом или кустарником, а также искусственными каменистыми включениями, в том числе и в альпинариях.
- Кроме того, всевозможные декоративные свойства кустарника активно используются и для:
- дополнения вересковых садов;
- создания густой растительности в тенистых зонах участка;
- украшения подпорных стенок;
- облагораживания искусственных и естественных склонов.
Сорта микробиоты
Несмотря на то, что микробиота представляет собой единственный вид в родовой систематике, сегодня известно сразу несколько сортовых гибридов растения. В отличие от дикорастущей формы, они отличаются повышенными эстетическими свойствами, что позволяет идеально дополнить любой дизайн сада в зависимости от конкретных условий.
Читайте также по этой теме:Смотреть все
Особенности цветения сосны Особенности цветения сосны Описание соснового семейства Описание соснового семействаЯкобсен
Микробиота Якобсен (microbiota jacobsen) отличается компактной кроной, которую формируют приподнятые, вертикально растущие побеги.
Со временем ветки характерно изгибаются, приобретая дугообразные очертания. Средняя высота взрослого куста (возрастом около 10 лет) составляет 40 см, однако максимальная может составлять около 1,5 м. При этом особая декоративная карликовость кустарника сохраняется на протяжении нескольких десятилетий.
Хвоя насыщенного зелёного цвета, который с осени до весны меняется на оттенки бурого.
Это довольно неприхотливое растение, оно может активно расти и развиваться практически на любых почвах, с минимумом питательных веществ. Однако наиболее декоративные экземпляры вырастают на хорошо удобренных супесчаных или суглинистых субстратах, с показателем pH в пределах 4,5–7,5. Любит сорт Якобсен и хорошее освещение, однако при отсутствии лёгкого притенения хвоя может получить термические ожоги.
Важно! Микробиота Якобсен гибнет даже при непродолжительной засухе, поэтому выращивать её в чрезмерно засушливых регионах не рекомендуется.
Карнавал
Это растение характеризуется мощными раскидистыми ветвями, прижатыми к грунту.
Взрослый куст в высоту не превышает 50 см, формируя крону до 1,5 м диаметром. При культивировании на протяжении 40 лет микробиота Карнавал (
Характерной особенностью сорта является насыщенная зелёная хвоя, кончики которой окрашены в жёлтый цвет. Эта особенность и стала главной причиной возникновения сортового названия.
Предпочитает микробиота Карнавал участки, расположенные в притенённых частях сада. При этом грядки должны отличаться умеренно влагоёмким и хорошо дренированным субстратом. К питательности почвы растение не выдвигает особых требований, поэтому может хорошо расти даже на бедных грунтах.
Голдспот
Микробиота сорта Голдспот (microbiota goldspot) имеет сразу несколько отличительных характеристик. Прежде всего, главной изюминкой растения считается нежный лимонный аромат, который на разломе источают хвоинки.
Кроме этого, основным окрасом хвои является насыщенный малахитовый цвет, подчёркнутый светло-жёлтыми ветками.
Отличается Голдспот повышенной теневыносливостью, именно поэтому его активно культивируют на участках с минимальным освещением. При этом сорт не переносит чрезмерного увлажнения и требует хорошо дренированного субстрата, со слабокислым показателем pH (4,5–5,8).
Оттенок растения по мере наступления холодов становится более насыщенным. Основные же габариты куста типичны, средняя высота взрослого растения составляет около 0,5–1 м, а диаметр кроны не превышает 2–3 м.
Лукас
Микробиота Лукас (microbiota lucas) имеет насыщенную зелёно-жёлтую хвою, которая в холодную пору года становится медно-коричневой. Куст отличается сверхкомпактностью, высота среднего растения составляет всего 25 см, при этом диаметр кроны не превышает 0,5–1 м. Эта особенность позволяет культивировать сорт Лукас и на участках с ограниченным пространством.
Хвоя на разломе выделяет лёгкий аромат с нотками кислинки, что является одной из особенностей гибрида.
Внешне такое растение напоминает гибрид хвойника либо стелющихся форм туи.
Для благополучного роста и развития сорт требует умеренно освещённых и хорошо удобренных территорий. Для этого лучше всего подходят суглинистые и супесчаные субстраты с высокой долей органических соединений. Лукас может переносить лёгкую засуху, при этом крайне важно, чтобы почва на участке была умеренно влагоёмкой, а также имела хороший дренаж.
Болезни и вредители
Несмотря на то, что микробиота известна в культуре уже более двух десятилетий, и по сей день не выявлен ни один видоспецифический вредитель и инфекция, которые могут нанести растению вред. Оно отличается повышенным иммунитетом ко всем известным в саду паразитическим насекомым, бактериальным, вирусным или грибковым инвазиям. Однако при несоблюдении умеренности полива кустарник может поражаться корневыми гнилями, но при соблюдении всех тонкостей выращивания культуры эта проблема не встречается.
Сегодня микробиота не считается традиционным элементом ландшафтного дизайна, поскольку в культуре этот кустарник широко известным стал всего несколько десятилетий назад. Однако это растение без внимания оставлять не стоит, ведь с его помощью можно дополнить практически любую садовую композицию. Но для этого, в первую очередь, потребуется создать эффективную систему орошения клумбы, а также качественный дренаж грунта.
Была ли эта статья полезна?
Спасибо за Ваше мнение!Напишите в комментариях, на какие вопросы Вы не получили ответа, мы обязательно отреагируем!
Вы можете посоветовать статью своим друзьям!
14 раз уже помогла
Хвойные в горшках 2-10 литров
1025 р
2 заказа
Можжевельник китайский Blue Alps
Китайский можжевельник «Блю альпс» подходит абсолютно по всем параметрам.
Это растение очень эстети…
Товар продан В архиве
1025 р
Можжевельник китайский Stricta
Можжевельник китайский Stricta представляет собой карликовое дерево семейства кипарисовых, которое…
Товар продан В архиве
1290 р
Можжевельник обыкновенный Goldschatz
Можжевельник обыкновенный Goldschatz низкорослый кустарник с раскидистой густой кроной. Крона имеет…
Товар продан В архиве
1290 р
Можжевельник горизонтальный Blue Forest
Можжевельник горизонтальный Блю Форест (Juniperus horizontalis Blue Forest). Разнообразные виды хво…
Товар продан В архиве
1090 р
1 заказ
Можжевельник горизонтальный Golden Carpet
Саженцы горизонтального можжевельника сорта Голден Карпет (Golden Carpet) можно использовать в ланд…
Товар продан В архиве
1290 р
Можжевельник горизонтальный Limeglow
Можжевельник горизонтальный Лаймглоу – очень декоративный невысокий почвопокровный кустарник.
Расте…
Товар продан В архиве
1450 р
Можжевельник лежачий Nana
Можжевельник лежачий Нана – небольшой низенький стелющийся ветвистый сорт можжевельника с плотной к…
Товар продан В архиве
Можжевельник скальный Blue Arrow
Можжевельник скальный Blue Arrow – высокий хвойный кустарник с очень узкой, колоновидной кроной. Же…
Товар продан В архиве
Можжевельник чешуйчатый Meyeri
Саженцы можжевельника чешуйчатого Мейери (Meyeri) привлекают внимание своей необычной раскидистой к…
Товар продан В архиве
Можжевельник средний Mint Julep
Можжевельник средний Mint Julep – раскидистый вечнозеленый кустарник с дуговидно-изогнутыми ветвями…
Товар продан В архиве
1150 р
Микробиота перекреснопарная Carnaval
Микробиота перекрестнопарная Carnaval (Карнавал) – очень декоративный раскидистый кустарник.
Растет…
Товар продан В архиве
Ель аянская
Ель аянская — типичный представитель горных темно-хвойных влажных таежных лесов Дальнего Востока, с…
Товар продан В архиве
Кедр Корейский
Кедр корейский — дерево 35-40, иногда — 45 м высоты и 1,5 и более метров в диаметре ствола; объем д…
Товар продан В архиве
Лиственница
Лиственница – это хвойное дерево, но при этом она обладает одним интересным свойством, выделяющим е…
Товар продан В архиве
Пихта белокорая
Пихта белокорая, или почкочешуйная – Abies nephrolepis (Trautv.). Maxim. Растет в горах Дальнего Во…
Товар продан В архиве
925 р
2 заказа
Пихта Корейская
Пихта корейская (abies koreana) – это хвойное, вечнозеленое дерево, принадлежит к семейству сосновы…
Товар продан В архиве
2800 р
Ель колючая Edith
Ель колючая ‘Edith’.
Picea pungens `Edith`. Медленнорастущее дерево с ровной красивой конической кр…
Товар продан В архиве
4480 р
Ель колючая Glauca Globosa
Ель колючую “Glauca Globosa” (Picea pungens “Glauca Globosa”), то Вы можете купить ее оптом и в роз…
Товар продан В архиве
2750 р
Ель колючая Hoopsii
Ель колючая Hoopsii (Picea pungens Hoopsii) – это одна из красивейших голубых елей, правильной кони…
Товар продан В архиве
3988 р
Ель колючая Maigold
Ель колючая Майголд (Picea Pungen Maigold) — декоративное дерево. В домашних условиях, произрастая…
Товар продан В архиве
1375 р
1 заказ
Ель Nidiformis
Ль обыкновенная Нидиформис (Picea abies Nidiformis).
Высота взрослого растения до 1 м, диаметр крон…
Товар продан В архиве
1420 р
Ель сербская Karel
Сербская ель «Карел» – карликовое хвойное дерево, выведенное Карелом Бунтинксом в конце прошлого ве…
Товар продан В архиве
1180 р
1 заказ
Ель колючая Majestic
Саженцы голубой ели Glauca Majestic Blue отличаются нарядным видом. Взрослое растение достигает в в…
Товар продан В архиве
1390 р
Сосна горная mugus
Сосна горная Мугус (Pinus mugo Mughus) – это кустарниковая форма густой сосны с ровной и пышной кро…
Товар продан В архиве
1440 р
Туя западная Danica Aurea
Саженцы туи западной Danica Aurea используют для одиночных посадок посреди газона, в групповых комп…
Товар продан В архиве
1440 р
Туя западная Little Gian
Саженцы (крупномеры) туи западной Литл Гиант(Little Giant) будут хорошо смотреться как в контейнере…
Товар продан В архиве
1440 р
Туя западная Yellow Ribbon
Туя западная.
Размер взрослого растения: Высота – 2-3 (4) м, диаметр кроны – до 1,5-2 м.
Очень ценн…
Товар продан В архиве
Туя западная Miky Teddy
Саженцы туи западной Мики (Miky) прекрасно подойдут как для высадки в грунт, так и в качестве конте…
Товар продан В архиве
1340 р
Можжевельник горизонтальный (Juniperus horizontalis Andorra Compact…
Можжевельник горизонтальный Андорра Компакт (Juniperus horizontalis Andorra Compact). Данная хвойна…
Товар продан В архиве
1590 р
Можжевельник горизонтальный (Juniperus horizontalis Andorra Compact…
Можжевельник горизонтальный Андорра Компакт (Juniperus horizontalis Andorra Compact). Данная хвойна…
Товар продан В архиве
Можжевельник горизонтальный (Juniperus horizontalis Glauca) C2
Можжевельник горизонтальный “Glauca” (лат.
Juniperus horizontalis “Glauca”) – это маленькое растени…
Товар продан В архиве
1580 р
Можжевельник лежачий (Juniperus procumbens Nana) C3 20-40
Саженцы можжевельника лежачего Нана (Nana) – прекрасный вариант почвопокровного декоративного куста…
Товар продан В архиве
1490 р
Можжевельник обыкновенный (Juniperus communis Arnold) C2 25-35
Можжевельник обыкновенный Арнольд (Juniperus communis Arnold). Можжевельник Арнольд – представитель…
Товар продан В архиве
1280 р
Можжевельник скальныи ̆ (Juniperus scopulorum Blue Arrow) C2 60
Можжевельник скальный Blue Arrow – высокий хвойный кустарник с очень узкой, колоновидной кроной. Же…
Товар продан В архиве
1280 р
Можжевельник средний (Juniperus media Mint Julep) C2
Ожжевельник Минт Джулеп средний – раскидистый вечнозеленый кустарник с дуговидно-изогнутыми ветвями…
Товар продан В архиве
1280 р
Можжевельник средний (Juniperus media Old Gold) C2 20-25
Можжевельник средний Old Gold один из лучших сортов можжевельника с золотистой листвой.
Благодаря я…
Товар продан В архиве
1380 р
Можжевельник средний (Juniperus pfitzeriana Pfitzeriana Aurea) C2
Можжевельник средний Pfitzeriana Aurea – декоративный кустарник с раскидистой кроной, вырастает до…
Товар продан В архиве
1075 р
Можжевельник горизонтальный (Juniperus horizontalis Andorra Variegata…
Ожжевельник горизонтальный “Andorra Variegata” (лат. Juniperus horizontalis “Andorra Variegata”) -…
Товар продан В архиве
1075 р
Можжевельник горизонтальный (Juniperus horizontalis Blue Chip C2 20-2…
Можжевельник горизонтальный Блу Чип – хвойное растение. Взрослое растение, при благоприятных услови…
Товар продан В архиве
1075 р
Можжевельник горизонтальный (Juniperus horizontalis Limeglow C2 30-40)
Можжевельник горизонтальный «Лайм глоу»: описание и выращивание.
Содержание. Описание. … Можжевел…
Товар продан В архиве
1075 р
Можжевельник казацкий (Juniperus sabina Tamariscifolia C2 25-30)
Juniperus sabina ‘Tamariscifolia’ Необычайно популярный в Европе вечнозеленый, хвойный невысокий ме…
Товар продан В архиве
1490 р
Можжевельник китайский (Juniperus chinensis Kuriwao Gold C5 50-60)
Можжевельник китайский Куривао Голд (Juniperus chinensis Kuriwao Gold) сильнорослый хвойный кустарн…
Товар продан В архиве
1075 р
Можжевельник чешуйчатый (Juniperus squamata Blue Carpet C2 20-25)
Uniperus Blue Carpet. Стандарт поставки: Укорененный саженец в горшке Р9, высота растения 10-15 см…
Товар продан В архиве
Можжевельник чешуйчатый (Juniperus squamata Holger C1 15+)
Можжевельник чешуйчатый Holger ( Холгер)- невысокий, раскидистый хвойный кустарник.
Высота взрослог…
Товар продан В архиве
Туя западная (Thuja occidentalis Golden Globe C2 10-25)
Саженцы туи западной Голден Глоб (Golden Globe) великолепно вписываются в небольшие палисадники, цв…
Товар продан В архиве
Больше, чем просто карнавальный трюк: Исследователи
изображение: Состав микробных сообществ, проживающих на вашей коже и в других местах, ваш «возраст микробиоты» теперь можно соотнести с вашим биологическим возрастом. посмотреть больше
Кредит: UC San Diego Health Sciences
Наши микробиомы — сложные сообщества микробов, которые живут в нас, на нас и вокруг нас — зависят от нашего рациона питания, привычек, окружающей среды и генов и, как известно, меняются с возрастом.
В свою очередь, состав наших микробиомов, особенно в кишечнике, хорошо известен своим влиянием на наше здоровье. Например, состав микробиома кишечника был связан с воспалительными заболеваниями кишечника, аутоиммунными заболеваниями, ожирением и даже неврологическими расстройствами, такими как аутизм.
Имея образец микробиома (кожа, мазок изо рта или фекальный мазок), исследователи продемонстрировали, что теперь они могут использовать машинное обучение для прогнозирования хронологического возраста человека с различной степенью точности. Образцы кожи обеспечили наиболее точный прогноз с точностью примерно до 3,8 лет по сравнению с 4,5 годами при пероральном исследовании и 11,5 годами при использовании образца кала. Типы микробов, живущих в ротовой полости или в кишечнике молодых людей (в возрасте от 18 до 30 лет), как правило, более разнообразны и многочисленны, чем в сравнительном микробиоме пожилых людей (в возрасте 60 лет и старше).
Инструмент прогнозирования, описанный в статье, опубликованной 11 февраля 2020 г.
компанией mSystems , был разработан в результате сотрудничества исследователей из Калифорнийского университета в Сан-Диего и IBM.
«Эта новая возможность коррелировать микробы с возрастом поможет нам продвинуться в будущих исследованиях роли микробов в процессе старения и возрастных заболеваниях, а также позволит нам лучше тестировать потенциальные терапевтические вмешательства, нацеленные на микробиомы», — сказал со-старший автор Чжэньцзян Зеч Сюй, доктор философии, который во время исследования был постдокторантом в лаборатории Медицинской школы Калифорнийского университета в Сан-Диего со старшим автором Робом Найтом, доктором философии, профессором и директором Центра инноваций микробиома Калифорнийского университета в Сан-Диего.
Конечной целью команды является создание аналогичных моделей машинного обучения для сопоставления микробиома и клинических состояний, таких как воспаление при аутоиммунных состояниях. Этот подход может когда-нибудь стать основой для неинвазивного теста на основе микробиома, который потенциально поможет клиницистам лучше диагностировать или оценивать риск заболевания у человека.
В исследовании 2014 года ученые Вашингтонского университета сравнили «микробный возраст» — возраст, предсказанный фекальным микробиомом, — и фактический хронологический возраст в контексте недоедающих младенцев в течение первых месяцев жизни. Исследователи отметили, что разница между хронологическим и микробным возрастом связана со степенью зрелости развития детей. В новом исследовании исследователи Калифорнийского университета в Сан-Диего продвинулись в этой идее на шаг вперед, чтобы увидеть, может ли эта ассоциация применяться к взрослым и насколько хорошо она распространяется на другие участки тела.
По словам Сюй, одним из наиболее важных требований к хорошей статистической модели является большой размер выборки и репрезентативная совокупность. Для этого исследователи изучили данные о секвенировании микробиома, доступные в общедоступных базах данных нескольких гражданских научных проектов, таких как Американский проект кишечника, в котором участники отправляют по почте мазки с фекалиями, слюной или кожей, получают свои персонализированные показания микробиома и вносят свои анонимные данные.
данных научному сообществу.
Исследование основывалось на 4434 образцах кала из США и Китая, 2550 образцах слюны из США, Канады, Великобритании и Танзании и 1975 образцах кожи из США и Великобритании. возраст от 18 до 90 лет, индекс массы тела от 18,5 до 30, отсутствие воспалительных заболеваний кишечника и сахарного диабета, неиспользование антибиотиков в течение как минимум одного месяца до взятия пробы. В исследование также не включались беременные, госпитализированные, инвалиды и люди в критическом состоянии.
«Это было самое всестороннее исследование микробиома и возраста на сегодняшний день», — сказал первый автор Ши Хуан, доктор философии, научный сотрудник лаборатории Найта и Центра инноваций микробиома Калифорнийского университета в Сан-Диего.
Команда обнаружила гендерные различия в результатах микробиома кишечника, но не обнаружила различий между мужчинами и женщинами, когда дело дошло до результатов микробиома полости рта и кожи. Несмотря на разнообразие микробов, обитающих в разных местах человеческого тела, также не имело значения, были ли взяты образцы кожи со лба или с рук, а это означает, что будущие исследования микробиома кожи могут повысить их статистическую мощность, комбинируя места сбора и пол.
Одной из возможных причин того, что микробы, живущие на нашей коже, так постоянно меняются с возрастом, по словам исследователей, являются предсказуемые изменения в физиологии кожи, с которыми сталкивается каждый, такие как снижение выработки сыворотки и повышенная сухость.
«Точность наших результатов демонстрирует потенциал применения методов машинного обучения и искусственного интеллекта для лучшего понимания микробиомов человека», — сказал соавтор Хо-Чеол Ким, доктор философии, руководитель программы «Искусственный интеллект для здорового образа жизни». между IBM Research и Калифорнийским университетом в Сан-Диего в рамках IBM AI Horizons Network. «Применение этой технологии к будущим исследованиям микробиома может помочь глубже понять корреляцию между тем, как микробиомы влияют на наше общее состояние здоровья и широкий спектр заболеваний и расстройств, от неврологических до сердечно-сосудистых и иммунных».
По словам соавтора Йошики Васкес-Баэсы, доктора философии, заместителя директора по биоинформационной интеграции в Центре инноваций микробиома Калифорнийского университета в Сан-Диего, прогнозирование возраста является особенно привлекательным методом для обучения прогностических моделей, поскольку участникам не нужно соответствовать особым критериям.
для того, чтобы стать донором образца, и оценка возраста обычно не требует посещения больницы.
«Другие исследования, которые сосредоточены на одном конкретном заболевании, таком как воспалительное заболевание кишечника, часто изо всех сил пытаются получить достаточно участников, которые соответствуют критериям исследования и готовы участвовать, чтобы иметь возможность делать значимые выводы», — сказал Васкес-Баеса. . «Но здесь широкая применимость предсказания возраста позволила нам исследовать пределы микробного моделирования в беспрецедентном масштабе».
«Узнание о том, как создавать точные и надежные модели на основе микробиома, откроет двери для ряда биотехнологических приложений и поможет нам лучше понять взаимосвязь определенных бактерий с интересующими нас результатами», — сказал Найт.
###
Среди дополнительных соавторов: Ребекка Ху, Линцзин Цзян, Бэйли Рассел, Селеста Аллабанд, Педро Белда-Ферре, Остин Д. Сваффорд, Калифорнийский университет в Сан-Диего; Ниина Хайминен, Анна-Паола Карьери, Лакшми Парида, Хо-Чеол Ким, IBM; Амир Зарринпар, Калифорнийский университет в Сан-Диего и система здравоохранения Сан-Диего по делам ветеранов; и Хунвэй Чжоу, больница Чжуцзян, Южный медицинский университет.
Раскрытие информации: Амир Зарринпар является соучредителем и владельцем акций Tortuga Biosciences.
Журнал
mSystems
Отказ от ответственности: AAAS и EurekAlert! не несут ответственности за достоверность новостных сообщений, размещенных на EurekAlert! содействующими учреждениями или для использования любой информации через систему EurekAlert.
Микробная трансплантация с комменсалами кишечника человека, содержащими CutC, достаточна для передачи повышенной реактивности тромбоцитов и потенциала тромбоза
1. Jonsson AL, Bäckhed F. Роль микробиоты кишечника при атеросклерозе. Нат Рев Кардиол. 2017;14:79–87. [PubMed] [Google Scholar]
2. Cho I, Blaser MJ. Микробиом человека: на стыке здоровья и болезни. Нат Рев Жене. 2012;13:260–270. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
3. Tang WHW, Hazen SL. Вкладная роль микробиоты кишечника в сердечно-сосудистых заболеваниях. Джей Клин Инвест.
2014; 124:4204–4211. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
4. Блэнтон Л.В., Барратт М.Дж., Шарбонно М.Р., Ахмед Т., Гордон Дж.И. Недоедание в детстве, микробиота кишечника и терапия, направленная на микробиоту. Наука. 2016;352:1533. [PubMed] [Google Scholar]
5. Turnbaugh PJ, Hamady M, Yatsunenko T, Cantarel BL, Duncan A, Ley RE, Sogin ML, Jones WJ, Roe BA, Affourtit JP, Egholm M, Henrissat B, Heath AC, Найт Р., Гордон Дж.И. Основной микробиом кишечника у тучных и худых близнецов. Природа. 2009; 457:480–484. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
6. Wu H, Esteve E, Tremaroli V, et al. Метформин изменяет кишечный микробиом у людей с диабетом 2 типа, ранее не получавших лечения, способствуя терапевтическому эффекту препарата. Природная медицина. 2017; 23:850–858. [PubMed] [Google Scholar]
7. Zhu W, Gregory JC, Org E, et al.
Кишечный микробный метаболит ТМАО повышает гиперреактивность тромбоцитов и риск тромбоза. Клетка. 2016; 165:111–124.
[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
8. Gregory JC, Buffa JA, Org E, Wang Z, Levison BS, Zhu W, Wagner MA, Bennett BJ, Li L, DiDonato JA, Lusis AJ, Hazen Сл. Передача предрасположенности к атеросклерозу при кишечной микробной трансплантации. Дж. Биол. Хим. 2015;290: 5647–5660. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
9. Тремароли В., Карлссон Ф., Верлинг М., Столман М., Ковачева-Дачари П., Ольберс Т., Фендрикс Л., Ле Ру К.В., Нильсен Дж., Бекхед Ф. Ру -en-Y Желудочный анастомоз и вертикальная полостная гастропластика вызывают долгосрочные изменения в микробиоме кишечника человека, способствуя регуляции жировой массы. Клеточный метаболизм. 2015;22:228–238. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
10. Gopalakrishnan V, Spencer CN, Nezi L, et al. Микробиом кишечника модулирует ответ на иммунотерапию анти-PD-1 у пациентов с меланомой. Наука. 2018;359: 97–103. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
11. Routy B, Le Chatelier E, Derosa L, et al.
Микробиом кишечника влияет на эффективность иммунотерапии эпителиальных опухолей на основе PD-1. Наука. 2018; 359:91–97. [PubMed] [Google Scholar]
12. Pluznicka JL, Protzkoa RJ, Gevorgyan H, et al. Обонятельный рецептор, реагирующий на сигналы кишечной микробиоты, играет роль в секреции ренина и регуляции артериального давления. Труды Национальной академии наук. 2013;110:4410–4415. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
13. Девлин А.С., Маркобал А., Додд Д., Найфах С., Пламмер Н., Мейер Т., Поллард К.С., Зонненбург Дж.Л., Фишбах М.А. Модуляция циркулирующего уремического растворенного вещества с помощью рациональных генетических манипуляций с микробиотой кишечника. Клеточный хозяин и микроб. 2016;20:709–715. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
14. Wang Z, Klipfell E, Bennett BJ, et al. Метаболизм фосфатидилхолина кишечной флорой способствует развитию сердечно-сосудистых заболеваний. Природа. 2011; 472:57–63. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
15.
Тан УХВ, Ван З., Левисон Б.С., Кет Р.А., Бритт Э.Б., Фу Х, Ву И, Хазен С.Л. Кишечный микробный метаболизм фосфатидилхолина и сердечно-сосудистый риск. N Engl J Med. 2013; 368:1575–1584. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
16. Koeth RA, Wang Z, Levison BS, et al. Метаболизм кишечной микробиоты L-карнитина, питательного вещества в красном мясе, способствует атеросклерозу. Природная медицина. 2013; 19:1–12. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
17. Bennett BJ, de Aguiar Vallim TQ, Wang Z, Shih DM, Meng Y, Gregory J, Allayee H, Lee R, Graham M, Crooke R, Edwards PA , Хазен С.Л., Лусис А.Дж. Триметиламин-N-оксид, метаболит, связанный с атеросклерозом, проявляет сложную генетическую и диетическую регуляцию. Клеточный метаболизм. 2013;17:49–60. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
18. Miao J, Ling AV, Manthena PV, Gearing ME, Graham MJ, Crooke RM, Croce KJ, Esquejo RM, Clish CB, Morbid Obesity Study Group, Vicent D , Биддингер С.
Б. Флавинсодержащая монооксигеназа 3 как потенциальный игрок в развитии атеросклероза, связанного с диабетом. Связь с природой. 2015;6:6498. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
19. Schugar RC, Shih DM, Warrier M, et al. Фермент, продуцирующий ТМАО, флавинсодержащая монооксигеназа 3, регулирует ожирение и образование белой жировой ткани. Представитель ячейки 2017; 19: 2451–2461. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
20. Shih DM, Wang Z, Lee R, Meng Y, Che N, Charugundla S, Qi H, Wu J, Pan C, Brown JM, Vallim T, Bennett Б.Дж., Грэм М., Хазен С.Л., Лусис А.Дж. Флавин, содержащий монооксигеназу 3, оказывает широкое влияние на метаболизм глюкозы и липидов и атеросклероз. J липидный рез. 2015;56:22–37. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
21. Qi J, You T, Li J, Pan T, Xiang L, Han Y, Zhu L. Циркулирующий N-оксид триметиламина и риск сердечно-сосудистых заболеваний: a систематический обзор и метаанализ 11 проспективных когортных исследований.
J Cell Mol Med. 2018;22:185–194. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
22. Heianza Y, Ma W, Manson JE, Rexrode KM, Qi L. Метаболиты кишечной микробиоты и риск серьезных неблагоприятных сердечно-сосудистых заболеваний и смерти: систематический обзор и метаанализ проспективных исследований. Ассоциация J Am Heart. 2017;6:e004947. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
23. Schiattarella GG, Sannino A, Toscano E, Giugliano G, Gargiulo G, Franzone A, Trimarco B, Esposito G, Perrino C. Кишечно-микробный метаболит триметиламин- N-оксид как биомаркер сердечно-сосудистого риска: систематический обзор и метаанализ зависимости от дозы. Европейский сердечный журнал. 2017;38:2948–2956. [PubMed] [Google Scholar]
24. Wang Z, Roberts AB, Buffa JA, et al. Нелетальное ингибирование продукции триметиламина микробами кишечника для лечения атеросклероза. Клетка. 2015; 163:1585–1595. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
25. Roberts AB, Gu X, Buffa JA, et al.
Разработка нелетального терапевтического средства, нацеленного на кишечные микробы, для подавления потенциала тромбоза. Природная медицина. 2018; [Epub перед печатью]. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
26. Зейзель Ш. Краткая история холина. Энн Нутр Метаб. 2012; 61: 254–258. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
27. Craciun S, Balskus EP. Микробное превращение холина в триметиламин требует радикального фермента глицила. Proc Natl Acad Sci USA. 2012;109:21307–21312. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
28. Мартинес-дель Кампо А., Бодеа С., Хамер Х.А., Маркс Дж.А., Хайзер Х.Дж., Тернбо П.Дж., Балскус Е.П. Характеристика и обнаружение широко распространенного кластера генов, который предсказывает анаэробное использование холина кишечными бактериями человека. мБио. 2015;6:e00042–15. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
29. Романо К.А., Вивас Э.И., Амадор-Ногес Д., Рей Ф.Е. Состав кишечной микробиоты модулирует биодоступность холина из пищи и накопление проатерогенного метаболита триметиламин-N-оксида.
мБио. 2015;6:e02481. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
30. Романо К.А., Мартинес-дель Кампо А., Касахара К., Читтим К.Л., Вивас Э.И., Амадор-Ногес Д., Бальскус Э.П., Рей Ф.Е. Метаболические, эпигенетические и трансгенерационные эффекты потребления холина кишечными бактериями. Клеточный хозяин и микроб. 2017;22:279–290. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
31. Романо К.А., Дилл-МакФарланд К.А., Касахара К., Керби Р.Л., Вивас Э.И., Амадор-Ногес Д., Херд П., Рей Ф.Е. Метод соломинок для аликвот фекалий (FAST) позволяет легко и воспроизводимо проводить подвыборку: оценка межличностных различий в накоплении триметиламин-N-оксида (ТМАО). Микробиом. 2018;6:91. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
32. Koeth RA, Levison BS, Culley MK, Buffa JA, Wang Z, Gregory JC, Org E, Wu Y, Li L, Smith JD, Tang WHW, DiDonato Дж.А., Лусис А.Дж., Хазен С.Л. γ-бутиробетаин является проатерогенным промежуточным звеном в кишечном микробном метаболизме L-карнитина до ТМАО.
Клеточный метаболизм. 2014; 20:799–812. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
33. Williams JA. Стрейн-инженерия: методы и протоколы. Springer Protocols Humana Press; 2011; 765: 389–407. [Google Scholar]
34. Heap JT, Kuehne SA, Ehsaan M, Cartman ST, Cooksley CM, Scott JC, Minton NP. ClosTron: мутагенез в Clostridium усовершенствован и оптимизирован. J Микробиологические методы. 2010;80:49–55. [PubMed] [Google Scholar]
35. Caporaso JG, Lauber CL, Walters WA, Berg-Lyons D, Huntley J, Fierer N, Owens SM, Betley J, Fraser L, Bauer M, Gormley N, Gilbert JA, Smith Г., Найт Р. Анализ микробного сообщества со сверхвысокой производительностью на платформах Illumina HiSeq и MiSeq. ISME J. 2012; 6: 1621–1624. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
36. Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, et al. QIIME позволяет анализировать данные секвенирования с высокой пропускной способностью. Нат Методы. 2010;7:335–336. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
37.
Копылова Э., Навас-Молина Дж. А., Мерсье С., Сюй З. З., Маэ Ф., Хе Ю., Чжоу Х.-В., Рогнес Т., Капорасо Дж. Г., Найт Р. Опен- Методы кластеризации исходных последовательностей улучшают состояние дел. mSystems. 2016;1:e00003–15. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
38. McDonald D, Price MN, Goodrich J, Nawrocki EP, DeSantis TZ, Probst A, Andersen GL, Knight R, Hugenholtz P. Улучшенная таксономия Greengenes с явными рангами для экологического и эволюционного анализа бактерий и архей. ISME J. 2012; 6: 610–618. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
39. Lozupone C, Knight R. UniFrac: новый филогенетический метод сравнения микробных сообществ. Appl Environ Microbiol. 2005; 71:8228–8235. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
40. McMurdie PJ, Holmes S. phyloseq: пакет R для воспроизводимого интерактивного анализа и графики данных переписи микробиома. ПЛОС ОДИН. 2013;8:e61217. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
41.
Zhu W, Wang Z, Tang WHW, Hazen SL. N-оксид триметиламина, генерируемый кишечными микробами из пищевого холина, оказывает протромботическое действие у субъектов. Тираж. 2017; 135:1671–1673. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
42. Херд П., Шеффер Н.К., ДиЛорето К., Жак К., Стивенсон Дж., Рей Ф., Роан С. Влияние социальных условий на протяжении всей жизни на микробиоту кишечника человека: пилотный проект с Висконсинским продольным исследованием. J Gerontol B Psychol Sci Soc Sci. 2017;73:124–133. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
43. Zhu Y, Jameson E, Crosatti M, Schafer H, Rajakumar K, Bugg TDH, Chen Y. Метаболизм карнитина в триметиламин необычной оксигеназой типа Риске у человека микробиота. Труды Национальной академии наук. 2014; 111:4268–4273. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
44. Тан УХВ, Ван З., Шреста К., Боровски А.Г., Ву И, Тротон Р.В., Кляйн А.Л., Хазен С.Л. Зависимые от кишечной микробиоты метаболиты фосфатидилхолина, диастолическая дисфункция и неблагоприятные клинические исходы при хронической систолической сердечной недостаточности.
Ошибка карты J. 2015;21:91–96. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
45. Тан WHW, Wang Z, Fan Y, Levison B, Hazen JE, Donahue LM, Wu Y, Hazen SL. Прогностическое значение повышенных уровней кишечного микробного метаболита триметиламин-N-оксида у пациентов с сердечной недостаточностью: уточнение гипотезы кишечника. J Am Coll Кардиол. 2014;64:1908–1914. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
46. Organ CL, Otsuka H, Bhushan S, Wang Z, Bradley J, Trivedi R, Polhemus DJ, Tang WHW, Wu Y, Hazen SL, Lefer DJ. Холиновая диета и ее кишечный микробный метаболит, N-оксид триметиламина, усугубляют сердечную недостаточность, вызванную перегрузкой давлением. Круговая сердечная недостаточность. 2016;9:e002314. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]
47. Sun G, Yin Z, Liu N, Bian X, Yu R, Su X, Zhang B, Wang Y. Микробный метаболит кишечника ТМАО способствует дисфункции почек при мышиная модель ожирения, вызванного диетой. Biochem Biophys Res Commun.